• June 13, 2024

Academic Biological Science Ressources

Human
  1. OMIM – Online Mendelian Inheritance in Man
  2. GENATLAS – Human genes atlas
  3. GeneClinics – Medical genetics knowledge base
  4. GDB – Genome Data Base
  5. GeneCards – Db integrating information on human genes
  6. The Genome Channel This system is a prototype graphical browser for querying the annotated reference genome.
  7. UDB – Unified db for Human genome mapping
  8. Ensembl Human genome browser
  9. UCSC human genome working draft
  10. TIGR HGI – TIGR Human Gene Index
  11. Hs UniGene – Human transcripts in GenBank (EST clusters)
  12. STACK – Sequence Tag Alignment and Consensus Knowledgebase (Db of consensus human ESTs)
  13. Allgenes.org – Human predicted gene index/catalog
  14. GenLink – Human genetics resource
  15. GeneLynx – Portal to the human genome
  16. GENOTK – Human cDNA db
  17. HUGE – Human Unidentified Gene-Encoded large proteins cDNA (KIAA…)
  18. HUNT – Human Novel Transcripts
  19. CGAP – Cancer Genome Anatomy Project
  20. MGC – Mammalian Gene Collection
  21. SCDb – Stem cell db
  22. Homophila – Human Disease to Drosophila gene db

Chromosomes

  1. Chr1 at Rutgers – Human chromosome 1 at Rutgers
  2. Chr1 at Sanger – Sanger Center chromosome 1 project
  3. Chr1 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 1
  4. Chr2 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 2
  5. Chr3 – Human chromosome 3 db at the University of Texas Health Science Center
  6. Chr3 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 3
  7. Chr4 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 4
  8. Chr5 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 5
  9. Chr6 at Sanger – Sanger Center chromosome 6 project
  10. Chr6 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 6
  11. Chr7 – Human chromosome 7 db at Ontario’s Hospital for Sick Children
  12. Chr7 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 7
  13. Chr8 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 8
  14. Chr9 at Sanger – Sanger Center chromosome 1 project
  15. Chr9 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 9
  16. Chr9 – Human chromosome 9 db
  17. Chr10 at Sanger – Sanger Center chromosome 10 project
  18. Chr10 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 10
  19. 11DB – Human chromosome 11 db at Imperial College (U.K.)
  20. Chr11 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 11
  21. Chr12 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 12
  22. Chr13 at Sanger – Sanger Center chromosome 13 project
  23. Chr13 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 13
  24. Chr14 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 14
  25. Chr15 UBC – Human chromosome 15 WWW page at UBC
  26. Chr15 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 15
  27. Chr16 LANL – Human chromosome 16 db at Los Alamos National Laboratory
  28. Chr16 TIGR – Human chromosome 16 db at TIGR
  29. Chr16 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 16
  30. Chr17 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 17
  31. Chr18 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 18
  32. Chr18 – Human chromosome 18 at Boston Children’s Hospital
  33. Chr19 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 19
  34. Chr20 at Sanger – Sanger Center chromosome 20 project
  35. Chr20 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 20
  36. Chr21 at RIKEN – Human chromosome 21 genome site at RIKEN (Japan)
  37. Chr21 at ERI – Human chromosome 21 genomic sequence db from the Eleanor Roosevelt Institute
  38. Chr21 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 21
  39. Chr22 at Sanger – Sanger Center chromosome 22 project
  40. Chr22 at HGC – Human genome center for chromosome 22
  41. Chr22 Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome 22
  42. ChrX at Sanger – Sanger Center chromosome 1 project
  43. IXDB – Integrated X chromosome db
  44. ChrX Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome X
  45. ChrY Swiss-Prot list – Links to Swiss-Prot entries from human chromosome Y
Bioinformatics- Human mutation resources/databases
  1. HGMD – Human Gene Mutation db
  2. SVD – EBI Sequence variation db
  3. HGBASE – Human Genic Bi-Allelic Sequences db
  4. GeneDis – Human genetic disease db
  5. The SNP consortium
  6. dbSNP – Human single nucleotide polymorphism (SNP) db
  7. ALFRED – Allele Frequency Db
  8. SeattleSNPs – UW-FHCRC Variation Discovery Resource
  9. PicSNP – Catalog of non-synonymous SNP
  10. List of mutation databases from OMIM
  11. List of mutation databases from IMT (Finland)
  12. ADAbase – Human adenosine deaminase (ADA) mutation db
  13. ADB – Albinism db (Mutations in human genes causing albinism)
  14. Albumin Web site
  15. Alpha-glucosidase – Information about human acid alpha-glucosidase (GSD-II)
  16. APC mutation
  17. AR mutations – Human androgen receptor mutation db
  18. Antithrombin mutation db
  19. Asthma and Allergy gene db
  20. BIOMDB – Db of mutations causing tetrahydrobiopterin deficiencies
  21. BLMbase – Human BLM mutation db (Bloom syndrome)
  22. BTKbase – Human BTK mutation db (X-linked agammaglobulinemia)
  23. CD3Ebase – Human CD3E mutation db
  24. CD3Gbase – Human CD3G mutation db
  25. CD40Lbase – Human CD40 ligand mutation db
  26. COL1/3 mutation – Human Type I and III collagen mutation db
  27. Connexin-deafness – Human connexins mutation db
  28. CFTR mutation – Human cystic fibrosis mutation db (CFTR)
  29. EMD db – Human Emerin (EMD) mutation db (Emery-Dreifuss muscular dystrophy)
  30. KMeyeDB – Eye disease genes db
  31. FVII mutation – Human Factor VII mutation db
  32. HAMSTeRS – Human Factor VIII mutation db (Haemophilia A)
  33. HAeMB – Human Factor IX mutation db (Haemophilia B)
  34. FBN1 mutation – Human fibrillin 1 mutation db (Marfan syndrome)
  35. G6PD – Human G6PD deficiency resource
  36. G6PDdb – Human G6PD mutation db
  37. Galt mutation – Human galactose-1-phosphate uridylyltransferase mutation db (Galactosemia)
  38. GNAS1 – Human GNAS1 mutation db
  39. GM2 gangliosidoses – Human Hexosaminidase A (HEXA), B (HEXB) and GM2A mutation db (Tay-Sachs/Sandhoff diseases)
  40. HbVar – Hemoglobin variants db
  41. Hereditary hearing loss homepage
  42. IL2RGbase – Human IL2RG (Interleukin-2 receptor gamma) mutation db (X-SCID)
  43. L1CAM mutation – Human L1CAM mutation db
  44. LDLR mutation – Human LDLR mutation db (Familial hypercholesterolemia)
  45. LHR – Human luteinizing hormone (LH) receptor mutation db
  46. LQTSdb – Long QT syndrome db
  47. NCF1base – Human NCF1 mutation db
  48. NCF2base – Human NCF2 mutation db
  49. Neuromuscular diseases web site
  50. NCL – Neuronal Ceroid Lipofuscinoses mutation db
  51. NF1 – NF1 Genetic Mutation Analysis Consortium web site
  52. OCRL1 – OCRL1 mutation db (Lowe Syndrome)
  53. OTCase – Human ornithine transcarbamylase (OTCase) website
  54. Cytochrome P450 alleles nomenclature
  55. p53 mutation db – University of Tokyo p53 mutation db
  56. Germline p53 mutation db – University of Prague db of germline p53 mutations
  57. PAHdb – Human phenylalanine hydroxylase (PAH) mutation db
  58. PAX2 mutation – Human PAX2 mutation db
  59. PAX6 mutation – Human PAX6 mutation db
  60. Prion – Prion and prion disease web site
  61. RAG1base – Human RAG1 mutation db
  62. RAG2base – Human RAG2 mutation db
  63. RB1base – Human retinoblastoma-associated protein (RB) mutation db
  64. RetNet – Retinal Information Network
  65. Retina International Scientific Newsletter – Information on Retinal genes, proteins and diseases
  66. Alsod.org – ALS/SOD1 genetic mutations db
  67. TSC – TSC (TSC1/TSC2) variation db
  68. TSC2 – Cardiff-Rotterdam Tuberous Sclerosis (TS) db (Tuberin; TSC2)
  69. TGDB – Tumor gene db
  70. VMD2 mutation – Human VMD2 mutation db
  71. vWF mutation – Human von Willebrand factor (vWF) mutation db
  72. WRN – Human WRN mutation db (Warner disease)
  73. WT1 mutation – Human WT1 mutation db
  74. X-ALD mutation – Human ABCD1 mutation db
    Vertebrates
    1. OMIA – Online Mendelian Inheritance in Animals
    2. MGI – Mouse Genome Informatics (includes MGD) [Mirrors in Australia UK Japan MGI – Mouse Genome Informatics (includes MGD) [Mirrors in Australia UK Japan ]
    3. Ensembl Mouse genome browser
    4. TIGR MGI – TIGR Mouse Gene Index
    5. Mm UniGene – Mouse transcripts in GenBank (EST clusters)
    6. MGC – Mammalian Gene Collection
    7. Mouse gene knockouts db
    8. Mouse chromosome 16 at Celera
    9. RGD – Rat genome db
    10. RatMAP – Rat genome db
    11. TIGR RGI – TIGR Rat Gene Index
    12. Rn Unigene – Rat transcripts in GenBank (EST clusters)
    13. BovBASE – Bovine genome db (in UK)
    14. BOVMAP – Bovine genome db (in France)
    15. Ark-Cat – Cat genome db
    16. HorseBASE – Horse genome db
    17. DGP – Dog Genome Project
    18. PiGBASE – Pig genome db
    19. SheepBASE – Sheep genome db (also known as SheepMap)
    20. MIS – Mendelian Inheritance in Sheep
    21. Chickmap – Chicken genome db (ChickBase)
    22. Turkey mapping db
    23. FishBase – Global information system on fishes
    24. Fugu genome project
    25. Fugu – HGMP Resource Centre Fugu Project (Fugu rubripes)
    26. Ensembl Fugu genome browser
    27. Medakafish – Mekada fish (Oryzias latipes) server
    28. Ark-Tilapia – Tilapia mossambica genome db
    29. The fish net – Zebrafish server
    30. Ensembl Zebrafish genome browser 
    Inveretbrates
    1. WormBase – C.elegans db [Mirror at Sanger ]
    2. C.elegans WWW server – at University of Texas Southwestern
    3. ACeDb – Caenorhabditis elegans db
    4. C.elegans Mitochondrial Directory – Data on C.elegans genes for mitochondrial proteins
    5. C.elegans EST – C.elegans EST db from Japan (Yuji Kohara’s group)
    6. C.elegans Swiss-Prot list – Links to C.elegans Swiss-Prot entries
    7. WormPep – C.elegans proteins db
    8. WormPD – C.elegans protein db
    9. Dictystelium Genome Sequencing project at BCM
    10. Dictyostelium discoideum genome project at IENA
    11. DictyDb – Dictyostelium discoideum db
    12. Dicty_cDB – Dictyostelium discoideum cDNA project
    13. Cone shells Web site
    14. Parasite genomes db and resources
    15. Parasite genomes WWW site
    16. PlasmoDB – P.falciparum genome db
    17. Malaria – WHO – Malaria db (from WHO)
    18. P.falciparum Sanger – P.falciparum genome project at Sanger
    19. PFDB – Plasmodium falciparum Genome db
    20. P.falciparum – Plasmodium falciparum Gene Sequence Tag project
    21. MAD – Malaria Antigen db
    22. Malaria parasite metabolic pathways
    23. Giardia lamblia genome project
    24. LGN – Leishmania Genome Network
    25. ToxoDB – Toxoplasma gondii genome project
    26. Trypanosoma brucei genome project
    27. Trypanosoma cruzi genome project
    28. kDNA – Kinetoplast Minicircle Sequence db
    Insects
    1. Drosophila Swiss-Prot list – Links to Drosophila Swiss-Prot entries
    2. FlyBase – Drosophila genetic and molecular db [Mirror at EBI ]
    3. BDGP – Berkeley Drosophila Genome Project
    4. FlyView – Drosophila image db
    5. GIFTS – Gene Interactions in the Fly Trans-World Server
    6. FlyNets – Db of molecular interactions in Drosophila melanogaster
    7. Drosophila P450 Web site
    8. Homophila – Human Disease to Drosophila gene db
    9. Mosquito Genomics
    10. AnoDB – Anopheles gambiae db
    11. Ensembl Mosquito genome browser
    Plants
    • NAL – AGIS – Access to many plant genome databases at the National Agricultural Library
    • Mendel – Plant gene nomenclature database from CPGN
    1. ARS Genome Database Resource is primarily a site for communication of Plant Genome data among scientists worldwide. The medium is a set of genome databases, similar to the ones for Human genome mapping and sequencing. They include data about plant genes, chromosome maps, DNA fingerprints, beneficial traits, and crop varieties that possess those traits.
    2. Arabidopsis Swiss-Prot list – Links to A.thaliana WWW sites and to Swiss-Prot entries
    3. TAIR – The Arabidopsis Information Resource
    4. MATDB – MIPS Arabidopsis thaliana db
    5. TIGR At – TIGR Arabidopsis thaliana db
    6. AMPL – Arabidopsis Membrane Protein Library
    7. Arabidopsis at PlaCe – Site with info on P450, glucosyltransferases, etc.
    8. Gramene – A comparative mapping resource for grains
    9. KOMUGI (Japan)
      GrainGenes , a genome database for Triticeae and related species. RiceGenes a genome database for rice.
    10. RGP – Rice Genome Research Program
    11. Oryzabase – Japanese rice genome db
    12. RiceGAAS: Rice Genome Annotation Database
      A rice genome automated annotation system; integrates programs for prediction and analysis of protein-coding gene structure.
    13. Rice-research.org – Monsanto rice genome site
    14. TIGR OsGI – TIGR Rice Genome project
    15. BeanGenes – Beans genome db
    16. ChlamyDB – Chlamydomonas reinhardtii genome db
    17. CottonDB – Cotton genome db
    18. MaizeDb – Maize genome db
    19. Mendel Bioinformatics Group , UK
      Mendel-ESTS , contains all of the plant EST and STS sequences currently in dbEST and dbSTS (>94,000) related to the sequences, grouped by gene family, in the Gene Family Database .
      Mendel-GFDb 
      Database of Genes Organized by Families. Now with Pfam, Prosite & TRANSFAC domain information
    20. Mendel-CPGN : developinging a common nomenclature for sequenced plant genes
    21. INRA Maize – INRA Maize genome db
    22. Plant Chromatin Database
      Database for chromatin proteins in plants, including functions and molecular phylogenetic relationships, with initial emphasis on Arabidopsis and maize
    23. TIGR Potato – TIGR Potato Functional Genomics project
    24. TIGR GmGI – TIGR Soybean Gene Index
    25. SolGenes — Genome Database for the Solanaceae
      A U.S.D.A.-funded Genome Database for the Solanaceae, containing information about potatoes, tomatoes, peppers, and related species.
    26. SorghumDB – Sorghum genome db
    27. SoyBase – Soybean genome db
    28. SoyBase metabolic db – Metabolic subset of the soybean genome db
    29. TIGR LeGI – TIGR Tomato Gene Index
    30. Dendrome – Forest trees genome db
    31. ZmDB Maize Genome Database
      Goals include discovering maize genes using EST sequencing and engineered Mu (RescueMu) tagging, and developing new tools to facilitate gene mapping and phenotypic analysis.
      Fungi
      1. FGSC – Fungal Genetics Stock Center
      2. FGR – Fungal Genome Resource
      3. Yeast Swiss-Prot list – Links to S.cerevisiae WWW sites and to Swiss-Prot entries
      4. CYGD – MIPS Comprehensive Yeast Genome db
      5. SGD – Saccharomyces genome db
      6. MitBASE-Pilot – Db of S.cerevisiae nuclear genes involved in mitochondrial biogenesis
      7. Yeast snoRNA – Yeast small nucleolar RNAs db
      8. YTPdb – Yeast Transport Protein db
      9. YMPL – Yeast Membrane Protein Library
      10. PathCalling – Yeast protein-protein interaction db
      11. S.pombe Swiss-Prot list – Links to S.pombe WWW sites and to Swiss-Prot entries
      12. GeneDB_SPombe – Schizosaccharomyces pombe GeneDB
      13. S.pombe genome project
      14. S.pombe NIH – S.pombe server at the NIH
      15. Forsburg lab pombe pages
      16. AGD – Ashbya genome db
      17. Aspergillus web site
      18. C.albicans Swiss-Prot list – Links to C.albicans WWW sites and to Swiss-Prot entries
      19. Candida albicans – Candida albicans server at the Univ. of Minnesota
      20. CandidaDB – Candida albicans genome db
      21. Neurospora crassa db
      22. NGP – Neurospora crassa genome project
      23. PC – Pneumocystis carinii genome project
      24. Phycomyces Web site – Resource site for scientists working on Phycomyces
      Bacteria
      1. WDCM – World Data Center for Microorganisms
      2. List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature
      3. CMR – TIGR Comprehensive Microbial Ressource
      4. GIB – Genome information broker for Microbial genomes
      5. GeneQuiz
      6. HOBACGEN – Homologous Bacterial Genes db
      7. Comparison of the transport capabilities of bacterial genomes – from Ian Paulsen
      8. BPGD – Bacterial polysaccharide gene db
      9. Bacterial quorum sensing
      10. MicrobeWorld – Educational site on microbes
      11. E.coli Swiss-Prot list – Links to E.coli WWW sites and to Swiss-Prot entries
      12. EcoWeb / EcoGene – Very comprehensive E.coli db
      13. ECCE – E.coli Cell Envelope Protein Data Collection
      14. ECDC – E.coli db collection
      15. EcoCyc – Encyclopedia of E.coli genes and metabolism
      16. GenProtEC – E.coli genome and proteome db
      17. Colibri – E.coli genome db from Pasteur Institute
      18. ECGC – E.coli Genome Center at Wisconsin University
      19. DDBJ E.coli – E.coli home page at DDBJ
      20. EcoReg – The E.coli regulation consortium
      21. B.subtilis Swiss-Prot list – Links to B.subtilis WWW sites and to Swiss-Prot entries
      22. SubtiList – Bacillus subtilis genomic db
      23. NRSub – Bacillus subtilis non-redundant db [Mirror in Japan ]
      24. Micado – Microbial advanced db (B.subtilis + E.coli)
      25. BSORF – Japanese server on B.subtilis
      26. DBTBS – Db of B.subtilis promoters and transcription factors
      27. A.actinomycetemcomitans – Actinobacillus actinomycetemcomitans strain HK1651 genome project
      28. B.anthracis at CNBP – Bacillus anthracis strain Ames WWW site
      29. B.halodurans – Bacillus halodurans strain C-125 db
      30. B.stearothermophilus – Bacillus stearothermophilus strain 10 genome project
      31. BGDB – Bordetella genome db
      32. B.bronchiseptica – Bordetella bronchiseptica strain RB50 genome project at Sanger Institute
      33. B.parapertussis – Bordetella parapertussis strain 12822 genome project at Sanger Institute
      34. B.pertussis – Bordetella pertussis strain Tohama I genome project at Sanger Institute
      35. BbDB – TIGR Borrelia burgdorferi genome db
      36. B.aphidicola Swiss-Prot list – Links to B.aphidicola Swiss-Prot entries
      37. iBGD – Integrated Buchnera genome db
      38. B.cepacia – Burkholderia cepacia genome project
      39. C.jejuni – Campylobacter jejuni strain NCTC 11168 genome project
      40. Chlamydia – Chlamydia pneumoniae and trachomatis
      41. C.muridarum – Chlamydia muridarum strain MoPn genome db at TIGR
      42. C.pneumoniae AR39 – Chlamydia pneumoniae strain AR39 genome db at TIGR
      43. C.pneumoniae J138 – Japanese Chlamydia pneumoniae strain J138 genome db http://www.brgene.lncc.br/indexCV.html
      44. C.michiganensis Claviabacter michiganensis subsp. sepdonicus genome project at Sanger Institute
      45. C.acetobutylicum – GTC Clostridium acetobutylicum strain ATCC 824 data
      46. C.difficile – Clostridium difficile strain 630 genome project at Sanger Institute
      47. C.diphtheriae – Corynebacterium diphtheriae strain NCTC 13129 genome project at Sanger Institute
      48. C.ruminantium – Cowdria ruminantium genome project at Sanger Institute
      49. C.hutchinsonii – Cytophaga hutchinsonii genome project
      50. DrDB – TIGR Deinococcus radiodurans strain R1 genome db
      51. D.hafniense – Desulfitobacterium hafniense genome project
      52. E.faecium – Enterococcus faecium genome project
      53. F.acidarmanus – Ferroplasma acidarmanus genome project
      54. F.tularensis – Francisella tularensis genome WWW site
      55. H.influenzae Swiss-Prot list – Links to H.influenzae WWW sites and to Swiss-Prot entries
      56. HiDB – Haemophilus influenzae genome db at TIGR
      57. H.pylori Swiss-Prot list – Links to H.pylori WWW sites and to Swiss-Prot entries
      58. HpDB – Helicobacter pylori strain 26695 genome db at TIGR
      59. H.pylori J99 – Helicobacter pylori strain J99 genome db at Astra
      60. PyloriGene – Helicobacter pylori genomic db
      61. L.lactis – Lactobacillus lactis subsp. lactis strain IL1403 genome db
      62. L.plantarum – Lactobacillus plantarum genome project
      63. ListiList – Listeria monocytogenes and Listeria innocua genome db
      64. MC-1 – Magnetococcus MC-1 genome project
      65. M.magnetotacticum – Magnetospirillum magnetotacticum genome project
      66. MycDB – Mycobacterium db
      67. M.bovis – Mycobacterium bovis strain AF2122/97 genome project
      68. Leproma – Mycobacterium leprae strain TN genome db
      69. M.leprae at Sanger – Mycobacterium leprae genome project at Sanger Institute
      70. TubercuList – Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv genome db
      71. MtDB – Mycobacterium tuberculosis strain Oshkosh genome db at TIGR
      72. M.tuberculosis at Sanger – Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv genome project at Sanger Institute
      73. M.tuberculosis secreted proteins
      74. M.tuberculosis structural genomics consortium
      75. M.genitalium Swiss-Prot list – Links to M.genitalium Swiss-Prot entries
      76. MgDB – Mycoplasma genitalium genome db at TIGR
      77. M.pneumoniae Swiss-Prot list – Links to M.pneumoniae Swiss-Prot entries
      78. M.pneumoniae – Mycoplasma pneumoniae genome project
      79. MypuList – Mycoplasma pulmonis genome db
      80. Mycoplasma synoviae genome db
      81. N.meningitidis A – Neisseria meningitidis serogroup A strain Z2491 genome project at Sanger Institute
      82. N.meningitidis B – Neisseria meningitidis serogroup B strain MC58 genome db at TIGR
      83. N.gonorrhoeae – Neisseria gonorrhoeae strain FA 1090 genome project
      84. N.europaea – Nitrosomonas europaea genome project
      85. N.punctiforme – Nostoc punctiforme genome project
      86. P.marinus – Prochlorococcus marinus genome project
      87. P.aeruginosa project – Pseudomonas aeruginosa genome project
      88. P.aeruginosa db – Pseudomonas aeruginosa genome db
      89. P.fluorescens – Pseudomonas fluorescens genome project
      90. R.solanacearum – Ralstonia solanacearum genome project
      91. Rhizobium pNGR234a Swiss-Prot list – Links to Rhizobium plasmid pNGR234a Swiss-Prot entries
      92. Rhizobium pNGR234a analysis
      93. RsGDB – Rhodobacter sphaeroides genome db
      94. R.sphaeroides – Rhodobacter sphaeroides genome project
      95. R.palustris – Rhodopseudomonas palustris genome project
      96. RicBase – Rickettsia conorii strain Malish 7 genome project
      97. R.prowazekii Swiss-Prot list – Links to Rickettsia prowazekii Swiss-Prot entries
      98. R.prowazekii – Rickettsia prowazekii strain Madrid E genome project
      99. S.typhi – Salmonella typhi strain CT18 genome project at Sanger Institute
      100. S.typhimurium Swiss-Prot list – Links to S.typhimurium Swiss-Prot entries
      101. S.typhimurium – S.typhimurium genome project
      102. RhizoBase – Sinorhizobium loti genome project
      103. S.meliloti – Sinorhizobium meliloti genome project
      104. S.aromaticivorans – Sphingomonas aromaticivorans genome project
      105. S.aureus – Staphylococcus aureus strain NCTC 8325 genome project
      106. S.mutans – Streptococcus mutans strain UAB159 genome project
      107. S.pyogenes M1 – Streptococcus pyogenes strain SF370 serotype M1 genome project
      108. S.pyogenes M5 – Streptococcus pyogenes strain Manfredo serotype M5 genome project at Sanger Institute
      109. S.suis – Streptococcus suis genome project at Sanger Institute
      110. S.uberis – Streptococcus uberis genome project at Sanger Institute
      111. S.coelicolor – Streptomyces coelicolor strain A3(2) genome project at Sanger Institute
      112. S.avermitilis – Streptomyces avermitilis strain MA-4680 genome project
      113. PCC 6803 Swiss-Prot list – Links to Synechocystis PCC 6803 Swiss-Prot entries
      114. CyanoBase – Synechocystis PCC 6803 db
      115. Synechococcus – Marine synechococcus genome project
      116. T.fusca – Thermomonospora fusca genome project
      117. TmDB – Thermotoga maritima genome db at TIGR
      118. TpDB – Treponema pallidum genome db at TIGR
      119. T.erythraeum – Trichodesmium erythraeum genome project
      120. T.whipplei – Tropheryma whipplei genome project at Sanger Institute
      121. U.urealyticum – Ureaplasma urealyticum genome WWW site
      122. VcDB – Vibrio cholerae genome db at TIGR
      123. Xanthomonas – Xanthomonas genome projects
      124. X.fastidiosa – Xylella fastidiosa genome WWW site
      125. X.fastidiosa at DOE – DOE Xylella fastidiosa genome project
      126. Y.enterocolitica – Yersinia enterocolitica strain 8082 genome project at Sanger Institute
      127. Y.pestis at Sanger – Yersinia pestis strain CO-92 Biovar Orientalis genome project at Sanger Institute
      128. Y.pestis at CNBP – Yersinia pestis genome WWW site
      Viruses & Phages
      1. All the virology on the WWW – links to virology WWW servers by David M. Sander
      2. ICTVdB – Universal virus taxonomy db
      3. AVIS – Animal Virus Information System
      4. Plants Viruses Online – Information on plant viruses
      5. Adenoviruses web site
      6. HCVDB – Hepatitis C virus db
      7. HIV – HIV and related species db
      8. HPV – Human papillomaviruses db
      9. Influenza sequence db
      10. Picornavirus – Picornavirus home page and access to db
      11. Tobamoviruses
      12. PhageBase
      13. Bacteriophage ecology group
      14. GOLD – Genomes On-line db
      15. DOGS – Database of genome size
      Archaea
      1. A.pernix – Aeropyrum pernix K1 genome db
      2. AfDB – Archaeoglobus fulgidus genome db at TIGR
      3. Halobacterium NRC-1 – Halobacterium strain NRC-1 genome project
      4. M.thermoautotrophicum – Methanobacterium thermoautotrophicum genome db
      5. M.jannaschii Swiss-Prot list – Links to M.jannaschii Swiss-Prot entries
      6. MjDB – Methanococcus jannaschii genome db at TIGR
      7. MjFdb – Methanococcus jannaschii functions db
      8. M.barkeri – Methanosarcina barkeri genome project
      9. Pyrococcus abyssi genome and re-annotation db
      10. P.abyssi – Pyrococcus abyssi genome project and db
      11. P.furiosus – Pyrococcus furiosus genome project
      12. P.horikoshii – Pyrococcus horikoshii OT3 db
      13. SGP – Sulfolobus solfataricus strain P2 genome project
      14. T.acidophilum – Thermoplasma acidophilum genome project
      15. T.volcanium – Thermoplasma volcanium genome project
      Mitochondrian & Chloroplast
      1. GOBASE – Organelle Genome Database
      2. MitoDat – Mendelian Inheritance and the Mitochondrion db (mitochondrial nuclear genes)
      3. MITOMAP – Human mitochondrial genome db
      4. MmtDB – Metazoa mitochondrial DNA variants db
      5. MitBASE – Integrated mitochondrial DNA db
      6. MitBASE-Pilot – Db of S.cerevisiae nuclear genes involved in mitochondrial biogenesis
      7. HvrBase – Primates mtDNA control region sequences compilation
      8. MOUSE – Mitochondrial and Other Useful SEquences (human and apes mit. DNA db)
      9. C.caldarium – Cyanidium caldarium strain RK1 chloroplast genome